基于NGS的克隆性测试的自动化和高度准确报告的新流程

2023年5月12日在Oncotarget的第14卷上发表了一篇新的研究论文，题为“基于NGS的克隆性测试的自动化和高度准确的报告过程的开发和实施”。

B细胞和T细胞在成为功能细胞之前，会经历免疫球蛋白基因座(B细胞)和T细胞受体的VH/DH/JH部分的随机重组。当一个VJ重排在B或T细胞群中过度表达时，表明起源于单个细胞，这表明克隆过程。克隆性有助于诊断和监测淋巴增生性疾病以及评估疾病复发。

在一项新研究中，罗斯威尔公园综合癌症中心的研究人员SeanT.Glenn、PhillipM.GalboJr.、JesseD.Luce、KierstenMarieMiles、PrashantK.Singh、ManuelJ.Glynias和CarlMorrison旨在制定目标可以自动将B和T细胞克隆性结果分类为阳性(克隆性)、无克隆性证据或无效(失败)的标准。

“使用具有通过PCR/CE测试获得的‘黄金标准’克隆性数据的临床样本，我们运行了基于NGS的扩增子克隆性分析，并开发了我们自己的克隆性报告模型。”

为了评估他们模型的性能，研究人员分析了其他已发表模型的NGS结果。他们使用基于NGS的技术进行克隆性识别的模型提高了检测的灵敏度，更准确地检测了克隆性。此外，他们还构建了一个计算管道，以使用他们的模型以自动化的方式客观地调用克隆性。

“总的来说，下面概述的结果将通过加快简明克隆性报告的审查和退出过程而产生直接的临床影响。”