在对生殖细胞存活至关重要的蛋白质中发现了不寻常的RNA结合特性

通过与Ciaudo(IMHS)和Hall(IPW,D-CHAB)实验室的合作，Allain小组(IBC)通过生化和细胞实验补充了死角蛋白对RNA识别的不寻常模式的结构性见解。结果发表在《自然通讯》上。

死胡同(DND1)对于脊椎动物生殖细胞的存活至关重要。该蛋白质具有两个RNA识别基序(RRM)结构域，后跟一个双链RNA结合结构域(dsRBD)。几个RNA结合结构域通常是同一蛋白质的一部分，但DND1结构域排列仅在其他两种蛋白质中发现。

RNA免疫沉淀实验表明RRM1在识别所有测试目标中的重要作用，而dsRBD仅在结合子集中起作用。在存在RRM2的情况下，RRM1对单个短RNA的亲和力增加了80倍。NMR结构揭示了串联RRM的结合共有序列和几个不寻常的RNA识别特征：RNA夹在RRM之间，RRM1延伸对于结合很重要。此外，尽管存在相对大量的可用RRM-RNA结构，但发现RRM2的一个区域与RNA相互作用，这是以前从未观察到的。

研究人员根据该结构设计了突变体，以进一步表征DND1RNA结合特性。此外，他们在纤维素实验中进行，再次指出dsRBD在RNA识别中的可有可无的作用，同时对可能独立于RNA结合的体内功能具有重要作用。最后，MassSpec的DND1相互作用组分析使研究人员讨论了DND1可能是颗粒结构的一部分的可能性。

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