研究着眼于病毒过去以预测未来的爆发
回顾过去可能有助于未来在人类对抗某些病毒时,特别是汉坦病毒的进化史。
Schuyler Liphardt,正在攻读博士学位。在新墨西哥大学的生物学专业,是一个团队的一部分,该团队最近在北美发表了一篇名为“ 复杂历史的复杂历史的复杂历史”的论文,该文章研究了北美地区的一种新发现的Soricid-Borne Orthohantavirus,探讨了汉坦病毒的进化史。
Liphardt的背景是作为野外生物学家和乳房专家。他曾与哺乳动物西南生物学博物馆合作七年。他的研究重点是汉坦病毒属(Hantaviriade)的进化,其中正嗜华病毒是其中的一员。他使用系统发育学来研究物种或基因等生物实体之间的进化关系,以研究进化史。他的研究将他带到阿拉斯加,巴拿马,蒙古,和新墨西哥州,从野生哺乳动物身上采集样本并对其进行筛选。
由于我们对汉坦病毒之间关系的了解最近有所进展,因此有必要重新命名某些群体,例如,由蝙蝠主持的汉坦病毒现在被称为“mobatviruses”或“loanviruses”。“Soricid”指的是一种以昆虫为食的小型哺乳动物。他解释说,所有导致人们生病的汉坦病毒都被重新归类为“邻性病毒”。
“我用遗传学来重建病毒的进化历史,以及承载这种病毒的哺乳动物,”他解释说,特别是蝙蝠,鼹鼠和sh .. 他研究了病毒从一个物种移动到另一个物种的历史模式,以及它在移动时如何变化或进化。他说,对过去的了解可以帮助预测它将来如何发挥作用,并且随着哺乳动物宿主随着气候变化而变化,我们可以预测疾病出现的 “热点” 可能发生在哪里。
病毒的进化历史很难研究。他解释说,很多推断生物进化历史的途径,如化石,都无法用于病毒。
“我们可以推断出进化史的唯一方法是观察生物相关病毒的存在,然后研究病毒本身的遗传学......我的研究主要集中在其中的一部分 - 宿主历史和生态学如何塑造当前的病毒多样性和分布 - 以汉坦病毒作为研究系统。这篇特定文章论述了单一病毒株Jemez Springs病毒如何在多物种宿主系统中传播和进化。“
Liphardt的研究调查了所谓的汉坦病毒及其哺乳动物寄主的系统发育史,这些寄主在野外维持它们。系统地理学使用遗传序列来推断个体之间的关系,在这种情况下,分别是病毒和宿主物种,然后将这种多样性映射到多个空间尺度。
结合对过去气候和地质历史的了解,他和他的研究人员可以推断出某些病毒和寄主物种如何以及何时达到今天的水平。
“然后我们可以比较病毒和宿主的这些不同的”关系树“,并可以推断病毒是否紧密跟踪宿主并且或多或少地特定于某种宿主物种,或者病毒是否可以轻易地从宿主中跳出来物种接种物种,很容易适应新宿主和增殖。病毒或任何病原体是否能够轻易地在宿主之间跳跃对于管理或缓解疾病非常重要,“Liphardt指出。
“气候变化不一定会在短期内影响病毒或其宿主的潜在生物学,但会影响病毒的流行,病毒在整个地区的移动或病毒的维持。例如,Sin农布雷病毒,汉坦病毒负责在90年代初期的四角地区汉坦病毒肺综合征的暴发,是紧密相连的厄尔尼诺周期,” Liphardt说。
湿循环导致鹿鼠群的繁殖,这增加了感染的小鼠进入住所并感染HPS(汉坦病毒肺综合征)的人的可能性。
“这是导致疾病流行率增加的临时气候事件的一个例子。在较长的规模上,随着气候变化减少了南部冬季的严重程度和时期,预计我们将在飓风中重新出现疟疾。以为例。这是因为气候变化从根本上改变了当地环境,使其更有利于蚊子的某些物种生存。气候变化正在改变全球的物种范围,扩大目前的范围可能会发生疾病。“
Liphardt指出,这项工作是过去十年左右多个机构之间的一次大型合作。该领域的乳腺科医生收集了样本,然后存档于各地的自然历史博物馆,即UNM西南生物博物馆,波特兰州立大学自然历史博物馆和北阿拉斯加大学博物馆。
“样本分布在整个北美西部......大量的实地工作,实验室工作和计算机工作,”他说。
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